Хромотрипсис

Хромотрипсис в раковых клетках

Хромотрипсис (греч. χρῶμα — цвет и τρiψις — фрагментация) — одномоментный клеточный кризис, ведущий к образованию сложных хромосомных перестроек.

Термин введён Филиппом Стивенсом с соавт. (Philip Stephens et al.) в публикации 2011 года, посвященной изучению геномных перестроек в раковых клетках при хроническом лимфолейкозе с помощью высокопроизводительного секвенирования спаренных концов. В данной работе авторы показали, что в клеточных линиях различных типов рака (2-3% всех изученных случаев) могут содержаться очень сложные перестройки, образовавшиеся единовременно после массивной фрагментации отдельного участка генома.

В дальнейшем последствия подобных катастрофических событий (хромотрипсиса) были обнаружены при анализе некоторых случаев врождённых сбалансированных транслокаций и при анализе сложных хромосомных перестроек у лиц с задержкой развития и/или умственной отсталостью. В настоящее время полагают, что в случае врождённого хромотрипсиса в перестройки вовлечены только отцовские хромосомы, то есть хромотрипсис происходит либо во время сперматогенеза, либо во время первых постзиготических делений.

1. ↑ Stephens PJ, Greenman CD, Fu B et al. Massive genomic rearrangement acquired in a single catastrophic event during cancer development // Cell. — 2011. — Т. 144, № 1. — С. 27-40. — PMID 21215367.
2. ↑ Chiang C, Jacobsen JC, Ernst C et al. Complex reorganization and predominant non-homologous repair following chromosomal breakage in karyotypically balanced germline rearrangements and transgenic integration // Nat Genet. — 2012. — Т. 44, № 4. — С. 392-7. — PMID 22388000.
3. ↑ Liu P, Erez A, Nagamani SCS et al. Chromosome catastrophes involve replication mechanisms generating complex genomic rearrangements // Cell. — 2011. — Т. 146, № 6. — С. 889-903. — PMID 21925314.
4. ↑ Kloosterman W. P. et al. Constitutional chromothripsis rearrangements involve clustered double-stranded DNA breaks and nonhomologous repair mechanisms (англ.) // Cell reports. — 2012. — Vol. 1, no. 6. — P. 648-655.
5. ↑ Stancu M. C. et al. Mapping and phasing of structural variation in patient genomes using nanopore sequencing (англ.) // Nature communications. — 2017. — Vol. 8, no. 1. — P. 1326. — DOI:10.1038/s41467-017-01343-4.